Jedna od osnovnih djelatnosti HHI je projektiranje, izrada, objavljivanje i održavanje u ažurnom stanju pomorskih karata u analognom (papirnom) i elektroničkom (ENC) obliku. Pomorske navigacijske karte su prikazi određenih plovidbenih područja s osnovnom svrhom omogućavanja sigurne plovidbe brodovima. Projektirane su i izrađene u Mercatorovoj projekciji, u različitim mjerilima, s obzirom na navigacijsku svrhu. Pomorske karte HHI-a obuhvaćaju plovidbena područja za sve navigacijske svrhe:
- Pregledne karte - Jadransko more, Jonsko more i ostali dijelovi Sredozemnog mora
- Generalne karte – Jadransko more i dio Jonskog mora
- Obalne karte – cijela istočna obala Jadranskog mora
- Prilazne karte – dijelovi istočne obale Jadranskog mora
- Lučki planovi – važnije luke, sidrišta i prolazi na istočnoj obali Jadrana
- Pristanišni planovi – važnije luke na hrvatskom dijelu obale Jadranskog mora
- Tematske karte - posebne karte koje se koriste uz navigacijske karte
- Ostale pomorske karte - arhivske karte i karte koje su stavljene izvan snage